BEGIN:VCALENDAR
VERSION:2.0
PRODID:-//pretalx//pretalx.com//pycones-2026//talk//ZD9EGF
BEGIN:VTIMEZONE
TZID:Europe/Madrid
BEGIN:STANDARD
DTSTART:20251108T000000
TZNAME:CET
TZOFFSETFROM:+0100
TZOFFSETTO:+0100
END:STANDARD
BEGIN:DAYLIGHT
DTSTART:20260329T030000
RDATE:20270328T030000
TZNAME:CEST
TZOFFSETFROM:+0100
TZOFFSETTO:+0200
END:DAYLIGHT
BEGIN:STANDARD
DTSTART:20261025T030000
RDATE:20271031T030000
TZNAME:CET
TZOFFSETFROM:+0200
TZOFFSETTO:+0100
END:STANDARD
END:VTIMEZONE
BEGIN:VEVENT
SUMMARY:Más allá del Global Interpreter Lock: Exprimiendo algoritmos gen
 ómicos con Numba\, Cython y CUDA. - Pablo Oca Galeano
DTSTART;TZID=Europe/Madrid:20261108T142000
DTEND;TZID=Europe/Madrid:20261108T150000
DTSTAMP:20260726T231331Z
UID:pretalx-pycones-2026-ZD9EGF@pretalx.com
DESCRIPTION:¿Cuál es el límite de Python cuando nos enfrentamos a probl
 emas de alta intensidad computacional en bioinformática? En esta charla s
 e presenta un análisis comparativo sobre la paralelización y distribuci
 ón de los algoritmos de Biclustering BiBit y BCCA\, esenciales para la b
 úsqueda de patrones en grandes matrices de datos genómicos.\nSe detallar
 á el proceso de transformación y optimización desde una implementación
  base en Python secuencial hacia cinco arquitecturas de alto rendimiento (
 HPC):\n1. Numba (CPU & GPU): Implementación de compilación Just-In-Time 
 (JIT) y kernels vectorizados.\n2. Cython: Optimización mediante tipado es
 tático y gestión eficiente de memoria a nivel de C.\n3. Cython + OpenMP:
  Estrategias de paralelismo multinúcleo nativo.\n4. Cython + CUDA: Desarr
 ollo de kernels de bajo nivel para la ejecución masiva en GPUs NVIDIA.\n\
 nA través de un riguroso benchmark\, compararemos métricas de aceleraci
 ón (speed-up)\, eficiencia energética y complejidad de implementación. 
 El objetivo es desglosar objetivamente bajo qué condiciones técnicas cad
 a una de estas herramientas es la opción óptima para superar las barrera
 s del rendimiento en el ecosistema Python.
LOCATION:Track 05
URL:https://pretalx.com/pycones-2026/talk/ZD9EGF/
END:VEVENT
END:VCALENDAR